Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab42Q0PD08 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab42Q0PD08 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms