Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lrriq1Q0P5X1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Lrriq1Q0P5X1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lrriq1Q0P5X1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms