Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2bQ0KL01 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2bQ0KL01 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms