Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kndc1Q0KK55 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kndc1Q0KK55 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms