Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms