Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13bQ07968 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13bQ07968 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F13bQ07968 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F13bQ07968 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F13bQ07968 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
F13bQ07968 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
F13bQ07968 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms