Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms