Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Siah1bQ06985 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Siah1bQ06985 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms