Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rcn1Q05186 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rcn1Q05186 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms