Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk18Q04899 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms