Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms