Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CkbQ04447 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CkbQ04447 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CkbQ04447 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CkbQ04447 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CkbQ04447 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CkbQ04447 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CkbQ04447 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CkbQ04447 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CkbQ04447 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CkbQ04447 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CkbQ04447 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CkbQ04447 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CkbQ04447 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CkbQ04447 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CkbQ04447 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CkbQ04447 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CkbQ04447 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms