Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scg2Q03517 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scg2Q03517 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms