Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cacna1sQ02789 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms