Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb5Q02739 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb5Q02739 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms