Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnnb1Q02248 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnb1Q02248 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms