Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms