Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col1a2Q01149 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col1a2Q01149 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms