Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Csf2raQ00941 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Csf2raQ00941 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Csf2raQ00941 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Csf2raQ00941 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Csf2raQ00941 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Csf2raQ00941 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Csf2raQ00941 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Csf2raQ00941 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms