Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp1Q00915 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms