Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou1f1Q00286 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou1f1Q00286 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms