Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VldlrP98156 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms