Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VldlrP98156 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VldlrP98156 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms