Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms