Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp2P97473 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp2P97473 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp2P97473 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp2P97473 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp2P97473 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp2P97473 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp2P97473 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp2P97473 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms