Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas1P97459 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas1P97459 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas1P97459 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Npas1P97459 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas1P97459 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms