Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crmp1P97427 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms