Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms