Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms