Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Irx3P81067 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx3P81067 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx3P81067 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx3P81067 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx3P81067 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irx3P81067 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irx3P81067 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx3P81067 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms