Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-Q6P79568 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms