Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1bP70700 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms