Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb6P70689 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb6P70689 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms