Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3eP70275 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sema3eP70275 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3eP70275 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms