Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2bP67871 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2bP67871 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2bP67871 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2bP67871 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Csnk2bP67871 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk2bP67871 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms