Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou3f4P62515 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f4P62515 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms