Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Depdc5P61460 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Depdc5P61460 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms