Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms