Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap25P60879 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap25P60879 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap25P60879 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap25P60879 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap25P60879 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snap25P60879 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snap25P60879 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snap25P60879 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snap25P60879 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snap25P60879 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snap25P60879 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snap25P60879 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snap25P60879 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms