Protein–RNA interactions for Protein: P59999

Arpc4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc4P59999 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arpc4P59999 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arpc4P59999 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arpc4P59999 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arpc4P59999 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arpc4P59999 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Arpc4P59999 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arpc4P59999 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arpc4P59999 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arpc4P59999 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arpc4P59999 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arpc4P59999 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arpc4P59999 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arpc4P59999 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms