Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps5P59438 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps5P59438 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps5P59438 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps5P59438 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps5P59438 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps5P59438 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hps5P59438 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps5P59438 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms