Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nphp4P59240 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nphp4P59240 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms