Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Csrnp3P59055 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Csrnp3P59055 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Csrnp3P59055 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Csrnp3P59055 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms