Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtdsplP58465 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms