Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strn4P58404 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strn4P58404 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strn4P58404 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strn4P58404 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strn4P58404 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Strn4P58404 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Strn4P58404 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms