Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snrpa1P57784 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms