Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TdgP56581 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TdgP56581 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TdgP56581 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TdgP56581 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TdgP56581 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TdgP56581 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TdgP56581 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TdgP56581 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TdgP56581 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TdgP56581 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TdgP56581 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TdgP56581 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TdgP56581 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TdgP56581 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TdgP56581 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TdgP56581 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TdgP56581 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TdgP56581 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TdgP56581 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TdgP56581 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TdgP56581 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TdgP56581 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TdgP56581 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TdgP56581 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TdgP56581 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TdgP56581 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TdgP56581 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TdgP56581 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TdgP56581 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TdgP56581 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TdgP56581 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TdgP56581 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TdgP56581 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TdgP56581 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TdgP56581 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TdgP56581 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TdgP56581 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TdgP56581 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TdgP56581 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TdgP56581 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TdgP56581 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TdgP56581 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TdgP56581 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TdgP56581 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TdgP56581 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TdgP56581 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TdgP56581 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TdgP56581 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TdgP56581 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TdgP56581 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TdgP56581 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TdgP56581 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TdgP56581 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TdgP56581 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TdgP56581 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TdgP56581 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TdgP56581 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TdgP56581 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TdgP56581 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TdgP56581 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TdgP56581 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TdgP56581 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TdgP56581 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TdgP56581 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TdgP56581 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TdgP56581 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TdgP56581 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TdgP56581 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TdgP56581 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TdgP56581 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TdgP56581 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TdgP56581 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TdgP56581 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TdgP56581 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TdgP56581 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TdgP56581 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TdgP56581 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TdgP56581 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TdgP56581 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TdgP56581 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TdgP56581 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TdgP56581 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TdgP56581 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TdgP56581 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TdgP56581 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TdgP56581 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TdgP56581 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TdgP56581 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TdgP56581 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TdgP56581 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TdgP56581 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TdgP56581 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TdgP56581 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TdgP56581 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TdgP56581 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TdgP56581 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TdgP56581 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TdgP56581 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TdgP56581 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms