Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab4aP56371 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms