Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab8aP55258 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab8aP55258 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms