Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms