Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pex2P55098 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pex2P55098 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pex2P55098 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pex2P55098 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pex2P55098 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pex2P55098 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms